Просто md5 не рекомендовал бы использовать. Сталкивался с пересечениями даже при количестве файлов в 4к штук.
Комбо вариант используйте. храните 2 хэша md5_file и sha1_file. Так вероятность пересечения будет меньше.
Просмотр поста #92261: Проверка файла на уникальность
Simba
Кадило крутится, лавэха мутится